Какая разница в комбиках для электрогитары и электроакустической гитары?

Разница в классе и в характере! ЦСКА!!!

А если серьезно? Можно вообще без особых потерь в звуке в комб для обычной элуктрогитары электроакустику подключить и наоборот?

Usualman, комбик для акустической гитары призван максимально точно передать звук. Комбо для электрогитары вносит определенные исажения (это сделано намеренно). В электрогитарный комбик можно включать акустическую гитару, однако, звук будет несколько иной.